Dự án nhà máy nhiệt điện Lý Sơn chưa đi vào hoạt động nhưng lại có nguy cơ ô nhiễm môi trường cao, ảnh hưởng rất lớn đến chiến lược phát triển huyện đảo theo hướng dịch vụ và du lịch của Ủy ban Nhân dân tỉnh Quảng Ngãi.

Chi phí xử lý số bùn, đất nhiễm thuốc trừ sâu quá lớn, trong khi đó vẫn chưa xác định được chủ thể chịu trách nhiệm trong việc chi trả

Hiện nay, các cống nước thải đen ngòm vẫn ngày đêm chảy thẳng ra biển, gây ô nhiễm nghiêm trọng vịnh Nha Trang, tỉnh Khánh Hòa