Dù loại bỏ bom hạt nhân, nhưng máy bay B-52H vẫn giữ lại dòng tên lửa hành trình có thể mang đầu đạn hạt nhân AGM-86B. Đây được đánh giá là một trong những loại tên lửa hành trình không đối đất nguy hiểm nhất thế giới.

Tên lửa AGM-86 có tầm bắn lên đến 2.500 km cho phép máy bay ném bom chiến lược B-52 diệt mục tiêu ngoài tầm của mọi hệ thống phòng không.